在线做图【干货】如何不使用R绘制气泡图？（一）

Question 1：什么是气泡图

气泡图（bubble chart）形似气泡，是用于展示三个变量之间关系的数据统计分析图表之一，它最多能够实现同一个事物的四个维度的直观的数据可视化。气泡图横纵坐标各是一个变量，第三个变量用气泡的大小来表示，与此同时还可以加入一个表示大小的变量进行比对。在生信分析中，GO/KEGG功能注释和富集分析气泡图是比较常见的。

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Question 2：如何不使用R绘制气泡图？

云图图（#/index）在线做图，操作步骤如下：

①登录网址：#/index（推荐使用360或者谷歌浏览器）

②输入用户名和密码（已经为大家填好了），输入验证码后即可登录，无需注册，直接使用，不必担心隐私泄露，是不是诚意满满~

③登录后在工具一栏（全部分析）里找到气泡图，点击进入；

④请按照界面右侧的说明书或者下文进行操作，即可在2分钟内获得气泡图。

话不多说，我们开始行动吧~

Step 1：上传文件

※目前平台仅支持.txt(制表符分隔)文本文件或者.csv文件的文件上传。(平台可对不规范的数据格式进行部分处理，但还是请您尽量按照示例数据的格式调整数据在线做图，以便机器可以识别)

a)准备一个数据矩阵（形式参照示例数据，如微生物物种丰度表、基因表达量矩阵、代谢物含量表，也可以是测量数据，例如身高、体重、表型等）；

b)表格需要带表头和列名，每一列为样本名，每一行为各种指标数据名，例如OTU，基因ID、身高、代谢物名称等。

c)请提交txt(制表符分隔)文本文件或者.csv文件。操作方法为：全选excel中的所有内容（ctrl+A），复制到记事本中，将记事本文件另存后点击“上传”按钮上传该文件。

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Step 2：参数设置

2.1 自定义横坐标：按照需求自行设置

2.2 自定义纵坐标：按照需求自行设置

2.3 绘制数量：绘制前多少个元素，剩余元素会合并成others展示

2.4 颜色选择：颜色1：高值颜色，颜色2:低值颜色

2.5 横坐标字体旋转：为图片美观旋转横坐标字体角度

Step 3：下载文件

点击“运行”开始作图，点击“下载”保存PDF格式的矢量图。PDF格式的文件可通过矢量图编辑工具进行编辑。

Step 4：作图后处理

TUTU云平台提供的是PDF格式的矢量图，可通过矢量图处理软件进行编辑和调整（如：文字字体，文字大小，图片分辨率等）。